Mayıs 2007 için arşiv

Online Genome Veri Tabanı (GOLD)

gold1.jpg

 

GOLD Online DATABASE  (yani  web üzerinden erişim sağlanabilen)  Genetik haritalaması yapılmış veya halen haritalama çalışmlaraı süren genetik veri bankaları .Gold web üzerindeki açık kaynaklı  veri tabanlarını ve yayınladıkları bilgileri bulabileceğiniz bir site…

Şimdi gelelim Gold ne işe yarıyor ? Gold genetik haritalaması bitmiş veya devam eden  dört grup organizmanın ( 2504 ade şu  anki rakam) genetik veri kodlarını bulnduruyor.Bu link e tılayarak http://www.genomesonline.org/gold.cgi  ulaşabileceğiniz ve kendi bilgisayarınıza indirebilir ve çeşitli güncellemeleri yapabilirsiniz.

Dört grup organizma (canlılara verilen genel isim )

->Archeal (geçmişte yaşamış günümüzde soyu tükenmiş veya ender olan canlılar) Grup . Bu grupta 56 adet yayınlanmış genome bulunmakta .İndirip çalışmlarınızda  kullanabileceğiniz halde ve  çeşitli blgileri de içermekte.Bu bilgiler yayımlandığı enstitü ,araştırmanın bağışını yapan kurum vb.

Okumaya devam edin ‘Online Genome Veri Tabanı (GOLD)’

Reklamlar

Genom Projesi: Ölüm Kalım Ekonomisi

wheel_1.gifBilindiği gibi, bilim dev şirketler demektir ve hiçbir bilim dalı bu tanıma genetikten daha fazla uyamaz. İnsan DNA’sını oluşturan 3,2 milyar kimyasal harfin şifresinin çözümü olan İnsan Genom Projesi şaşırtıcı ilerlemeler kaydetmiş durumda. 13 yılın sonunda projenin 2 milyar harflik kısmı tamamlandı. Bu harflerin her biri bir molekülü temsil etmekte olup, insan vücudunun, kaslarının, derisinin, karaciğerinin vb. (kırmızı kan hücreleri hariç[*]) her hücresi aynı DNA’nın bir kopyasını barındırır. Bir türün hücrelerindeki DNA bütünü, onun genomudur.

Hayata ilişkin bilimsel kavrayışımız dörtnala koşmaya hazırlanırken, kendimizi bir kez daha kapitalizmin devasa israfıyla kuşatılmış buluyoruz. İşi tamamlamak için birbiriyle “yarışan”, zaman ve kaynak harcayan 5 büyük labotauvar var. Bu yılın başlarında ABD’de devletin finanse ettiği araştırmanın başında bulunan Francis Collins, özel Celera firmasının birlikte çalışma önerisini, elde ettikleri sonuçları 5 milyon dolar verilmedikçe altı ay süreyle kendilerine sakladıkları için reddetti. Rekabet + kâr, israfa eşit oluyor. Elbette basın homoseksüellik ve suç eğilimi hakkındaki histerik saçmalığı körüklüyor. Okumaya devam edin ‘Genom Projesi: Ölüm Kalım Ekonomisi’

Samantha Kleinberg ile CL-GODB, Common Lisp ve Biyoinformatik Üstüne

New York Üniversitesi’nden Samantha Kleinberg, 2005 yılında Google’ın “Summer of Code” etkinliğine katılmış başarılı yazılımcılardan biri. Kendisi Common Lisp programlama dilini kullanarak CL-GODB projesini geliştirdi. Google ünlülerinden biri oluşu ve Common Lisp kullanmış olması dikkatimizi cezbetti ve her türlü engelip aşıp kendisine detaylı sorularımızı yönelttik. O da bizi kırmadı ve gayet net, konuya dair cevaplar verdi. Yayındayız…

Emre Sevinc: Samantha, bize geçmişin hakkında biraz bilgi verir misin? Bilgisayarları kurcalamaya ne zaman başladın? Bilgisayar bilimlerinin hangi alanlarında nasıl uzmanlaştın?

Samantha Kleinberg: İlk olarak 5. sınıfta başlamıştım ama lise yıllarıma kadar ciddi bir programlama deneyimim olmamıştı. Mount Sinai’nin Biyomatematik departmanında staj yaptığımda herkes çok sabırlı ve destekleyici idi ancak o zaman henüz yeterli deneyime sahip değildim. Favori hatıram bir sistem yöneticisine yaptığım bir metin dosyasını nasıl ASCIIye dönüştüreceğimi sorduğum zamandır. Ancak sonra Unix in a Nutshell‘i sayfa sayfa okudum, ardından Perl ve MySQL çalıştım. Fizik ve bilgisayar bilimleri alanında eğitimimi tamamladıktan sonra tekrar biyoinformatik alanına döndüm. Programlama becerilerimi, matematik, fizik ve biyoloji bilgimi insanların üzerinde açık ve net bir etkisi olacak işler kullanmaktan gerçekten hoşlanıyorum.
Okumaya devam edin ‘Samantha Kleinberg ile CL-GODB, Common Lisp ve Biyoinformatik Üstüne’


Tbg.org.tr

İstatistikler

  • 411.522 Kişi ziyaret Ettti

RSS Türk Biyoinformatik Grubu

  • Bir hata oluştu; besleme kapalı gibi görünüyor. Lütfen daha sonra tekrar deneyin.
Reklamlar